Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms