Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms