Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms