Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms