Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIT2Q99578 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms