Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms