Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms