Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NMD3Q96D46 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms