Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms