Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms