Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms