Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms