Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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