Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms