Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC22A9Q8IVM8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A9Q8IVM8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms