Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms