Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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