Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPRIN2Q6IMN6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPRIN2Q6IMN6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms