Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf135Q5VTT2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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