Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms