Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms