Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.9 ms