Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms