Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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