Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms