Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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