Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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