Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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