Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IHHQ14623 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms