Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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