Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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