Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms