Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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