Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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