Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EGR3Q06889 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms