Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms