Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms