Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms