Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms