Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms