Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms