Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms