Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms