Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms