Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms