Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms