Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms