Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL3P58872 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms