Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms