Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms